| Πρέκτηος ή Πρεκτήκιος (Επίσκοπος Σερρών υπό τον Θεσσαλονίκης) | 3ος - 4ος αιώνας | |
| Μαξιµίνος ή Μαξιµιανός (Επίσκοπος Σερρών υπό τον Θεσσαλονίκης) | Το 449 συµµετείχε στη Σύνοδο της Εφέσου την επονοµαζόµενη «Ληστρική». | |
| Θεοφάνης (Επίσκοπος Σερρών υπό τον Θεσσαλονίκης) | 783 | |
| Η Εκκλησία των Σερρών στο µεσοδιάστηµα 901 - 906 προβιβάζεται σε Αρχιεπισκοπή |
| Λεόντιος Πρώτος (Μητροπολίτης της Εκκλησίας των Σερρών) | 996 | |
| Γρηγόριος | Πριν από το 1070 | |
| Στέφανος | 1071 | |
| Νικήτας ο και Ηρακλείας | 1077 | |
| Βασίλειος Α΄ | 1142 | |
| Θεόδωρος Μαντζούκης | 1166 | |
| Ιωάννης | 1191 | - | 1192 | |
| Φίλιππος Α΄ | 11/12ος αιώνας | |
| Αρνούλφος (Λατίνος) | 1204 | - | 1222 | |
| Γοριανίτης | 1222 | - | 1230 | |
| Λέων | 1269 | |
| Νήφων | περί το 1309 | |
| Νικόλαος Α΄ | 1315 | |
| Μακάριος Α΄ | 1329 - άνοιξη του 1348 | |
| Από την άνοιξη του 1346 η Μητρόπολη Σερρών αποκόπτεται από το Οικουµενικό Πατριαρχείο και περνά στην δικαιοδοσία του νεοσύστατου Πατριαρχείου Πεκίου και Σερβίας |
| Ιάκωβος, (Σέρβος) | 1348 - άνοιξη 1365 | |
| Σάββας, (Σέρβος) | 1365 - καλοκαίρι 1367 | |
| Από το καλοκαίρι του 1367 έως και την άνοιξη του 1369 την Εκκλησία των Σερρών εποίµανε ο Αρχιεπίσκοπος Αχρίδος Γρηγόριος |
| Θεοδόσιος, Σερρών και Τραϊανουπόλεως (Σέρβος. Από τον Μάϊο του 1371 η Εκκλησία των Σερρών ενώνεται και πάλι µε το Οικουµενικό Πατριαρχείο) | 1369 | - | 1375 | |
| Ματθαίος Α΄ ο Φακρασής (Από το 1383 έως και το 1388 η Μητρόπολη Σερρών διοικείται προεδρικώς από τον Μητροπολίτη Ζιχνών Μακάριο) | 1376 | - | 1393 | |
| Νικόλαος Β΄ (Πρόεδρος Φιλίππων) | 1393 | - | 1397 | |
| Ιγνάτιος | 1421 | - | 1422 | |
| Μακάριος Β΄ | 1447 | - | 1457 | |
| Η Εκκλησία των Σερρών διευθύνεται προσωρινά από τον Oικουµενικό Πατριάρχη Γεννάδιο Β΄ Σχολάριο | 1457 | - | 1465 | |
| Γερµανός | 1466, 1467 | |
| Φίλιππος Β΄ | 1467 (;) | |
| Δωρόθεος | 1474 | |
| Μακάριος Γ΄ | 1486 | |
| Μανασσής | 1486 - αρχές του 1491 | |
| Κάλλιστος | 1491 - αρχές του 1499 | |
| Ματθαίος Β΄ | 1499 (από µήνα Μάιο) | |
| Γεννάδιος | 1512 | - | 1540 | |
| Αρσένιος | 1541 | - | 1564 | |
| Προκόπιος | 1572 | |
| Δανιήλ | 1573 (;) | |
| Νεόφυτος Α΄ | 1574 | - | 1575 | |
| Διονύσιος | 1588 | |
| Ανανίας | 1590 | |
| Θεόδουλος (Θεόφιλος;) | 1593 | |
| Αρσένιος Β΄ | Προ του 1600 | |
| Ιωάσαφ (α) | 1600 | - | 1602 | |
| Θεοφάνης Φλωράς (α) | 1602 | - | 1605 | |
| Ιωάσαφ (β) | 1605 | - | 1606 | |
| Θεοφάνης Φλωράς (β) | 1606 | - | 1613 | |
| Δαμασκηνός | 1613/4 - 1617 | |
| Τιμόθεος | 1616 | - | 1625 | |
| Αχίλλιος | 1625 | - | 1628 | |
| Δανιήλ | 1628 | - | 1638 | |
| Γαλακτίων | 1638 | - | 1639 | |
| Κύριλλος (α) | 1639 | - | 1650 | |
| Κύριλλος (β) | 1650 | - | 1676 | |
| Νεκτάριος | 1676 | - | 1677 | |
| Άνθιμος | 1678 - 1705/6 | |
| Γρηγόριος | 1690 | |
| Ναθαναήλ | 16/17ος αιώνας | |
| Στέφανος | 1706 | - | 1728 | |
| Παρθένιος | 1728 | - | 1735 | |
| Γαβριήλ | 1735 | - | 1745 | |
| Ιωαννίκιος Γ΄ | 1745 | - | 1769 | |
| Μελέτιος | Ιούλιος 1768 | |
| Άνθιμος Β΄ | 1778 | - | 1779 | |
| Ματθαίος Β΄ | 1779 | - | 1791 | |
| Κωνστάντιος | 1791 | - | 1811 | |
| Χρύσανθος (μετέπειτα Οικουμενικός Πατριάρχης) | 1824 | - | 1829 | |
| Πορφύριος | 1824 | - | 1829 | |
| Άνθιμος Γ΄ (μετέπειτα Οικουμενικός Πατριάρχης) | 1830 | - | 1833 | |
| Γρηγόριος Β΄ (μετέπειτα Οικουμενικός Πατριάρχης) | 1833 | - | 1835 | |
| Ιάκωβος Κασσανδρείας (Επίτροπος) | 1834 | - | 1836 | |
| Νεόφυτος Δράμας (Επίτροπος) | 1836 | - | 1838 | |
| Αθανάσιος | 1838 | - | 1846 | |
| Ιάκωβος Β΄ (ο από Κασσανδρείας μετέπειτα πατριάρχης Αλεξανδρείας) | 1846 | - | 1860 | |
| Νικόδημος | 1860 | - | 1861 | |
| Μελέτιος | 1861 | - | 1867 | |
| Νεόφυτος | 1867 | - | 1875 | |
| Φιλόθεος Βρυέννιος | 1875 | - | 1877 | |
| Γρηγόριος Γ΄ | 1877 | - | 1879 | |
| Ναθαναήλ | 1879 | - | 1886 | |
| Λουκάς Πετρίδης | 1886 | - | 1888 | |
| Κωνσταντίνος Βαφείδης | 1888 | - | 1892 | |
| Ναθαναήλ Προύσης και Κωνστάντιος Κασσανδρείας - Επίτροποι | 1891 | - | 1892 | |
| Γρηγόριος Ζερβουδάκης (μετέπειτα Οικουμενικός Πατριάρχης) | 1892 | - | 1909 | |
| Αθανάσιος Πιπέρας | 1909 | |
| Απόστολος Χριστοδούλου | 1909 | - | 1917 | |
| Χριστοφόρος (Κνίτης) | 1918 | - | 1924 | |
| Κωνσταντίνος Α΄ | 1924 | - | 1961 | |
| Κωνσταντίνος Β΄ | 1965 | - | 1984 | |
| Μάξιμος (Ξύδας) | 1984 | - | 2003 | |
| Θεολόγος (Αποστολίδης) | 2003 | - | Σήμερα | |
